如果亚马逊被他人注册了营业执照，是会有影响的。
一、责任追究方面
在运营过程中，如果因为某些原因导致了经济损失，亚马逊会根据店铺注册信息（包括营业执照等企业信息）来追究相关责任。若营业执照被他人注册用于亚马逊店铺，出了问题可能需要营业执照所有者承担责任，比如他人用该店铺销售违禁品或者有其他违规行为等。
二、账户关联方面
亚马逊对于账户关联有严格的规定。如果他人用注册的营业执照运营的店铺与其他店铺产生关联，例如在卖家持有、经营、参与或者有权访问多个亚马逊销售账户的情况下，被视为有多个或相关联的销售账户。一旦关联账户出现问题，如其中一个账户有审核问题或者违规行为，可能会影响到其他相关联的账户，进而影响到营业执照所有者关联的店铺销售权益。
三、审核与合规方面
亚马逊要求卖家的注册公司必须是合法的实体并且在所在国家或地区进行正式注册，要有相关的营业执照和税务登记证明等文件。如果营业执照被他人注册，在审核过程中可能会出现资料不匹配或者不符合要求的情况，导致审核失败。并且如果他人注册时使用的营业执照资料可能被多次使用，也不符合亚马逊的要求，会带来诸多风险和不确定性。