京东保证金欠费是有可能被清退的。
京东对于商家保证金有明确规定。若商家出现违规行为或符合与京东签署平台协议中约定的被清退情形，京东开店保证金在清退时不予退还。当商家存在保证金欠费情况，这很可能违反了相关协议约定，京东有权依据规则对商家进行处理，清退便是可能的处理方式之一。
关于公告内容，通常会详细说明保证金的各项规则。比如，商家申请退出（或被清退）京东开放平台时，需满足一定条件。要在所有订单终止、所有索赔完结且已完成交易的所有商品质保期均届满后，才可以向京东发起退还保证金的申请。而且自终止合作之日起满3个月，在商家符合审批条件（像申请材料齐全、信息完整无误、签字盖章完整、无未结算完的结算单等）的情况下，京东会扣除依据协议及相关规则等应扣除的部分后，将保证金余额退还至商家已验证支付保证金的公司账户中。