店铺闲置不注销是否会一直扣月租，需要分情况来看。
如果店铺与相关方签订了月租缴纳协议，且协议中没有明确在店铺闲置时可以停止计费，那么即便店铺闲置，也很可能会按照协议一直扣除月租。比如一些商业综合体的商铺，租户和商场管理方签订了租赁合同，约定每月缴纳固定租金。在这种情况下，只要合同未终止，不管店铺是否正常经营，管理方都会按照合同规定扣除月租。若不按时缴纳，还可能产生滞纳金，增加额外费用。
要是店铺没有月租相关的协议，自然不存在一直扣月租的问题。例如一些个体工商户，在自有房产内经营，不存在租赁场地费用，也就不会有月租扣除。
另外，即使没有月租，但店铺闲置不注销可能会带来其他不良影响。从税务方面看，若不按时申报纳税，会被税务机关列入异常名录，影响个人信用。在工商登记上，长期不经营且不注销，可能会被吊销营业执照，这会对法人以后再注册公司等行为产生限制。