独立站可以建立多个店铺。从技术层面来看，独立站是完全由卖家自主掌控的网站，只要有足够的资源和精力，就能够搭建多个不同类型的独立站店铺。比如卖家可以针对不同的目标市场、产品品类分别创建独立站，通过差异化运营来拓展业务。
而关于独立站与亚马逊哪个更好做，这需要从多个方面来分析。
运营自主性：独立站具有高度的自主性，卖家可以自由设计网站界面、制定营销策略、管理客户数据等。但这也意味着卖家需要自行解决网站建设、推广、物流等一系列问题。亚马逊则是一个成熟的电商平台，平台已经提供了相对完善的基础设施和服务，卖家只需专注于产品和销售，但在运营上会受到平台规则的限制。
流量获取：独立站的流量需要卖家通过各种渠道去推广和引流，如搜索引擎优化、社交媒体营销等，前期获取流量的难度较大。亚马逊本身拥有庞大的用户流量，卖家的产品有更多机会被曝光，但同时也面临着激烈的竞争。
成本：独立站的建设和维护需要一定的技术和资金投入，包括域名注册、服务器租赁、网站开发等。亚马逊则主要收取平台佣金和其他相关费用。